MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC2

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012795	ACT	2	6	44	49	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012795	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012795	CCCTG	2	10	2060	2069	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_012795	T	6	6	2121	2126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012795	TATT	2	8	2179	2186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012795	T	7	7	2189	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012795	A	7	7	2281	2287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012795	GGT	2	6	3943	3948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012795	AAG	2	6	4120	4125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012795	A	7	7	4132	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012795	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012795	GGT	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012795	GCA	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012795	GCA	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012795	TAGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012795	T	6	6	5230	5235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012795	T	6	6	5320	5325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012795	TTC	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012795	TTC	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012795	CTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012795	ATC	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012795	GTA	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012795	CTTT	2	8	5466	5473	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012795	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012795	AATT	2	8	5560	5567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012795	TCATGT	2	12	5585	5596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012795	TAT	2	6	5627	5632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012795	ACAAAT	2	12	5640	5651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012795	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012795	A	8	8	5689	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012795	GTTT	2	8	5778	5785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012795	T	7	7	5810	5816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012795	AAC	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012795	TGC	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012795	AAT	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012795	TTTTG	2	10	6385	6394	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012795	TCTTAC	2	12	6424	6435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012795	T	6	6	6462	6467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012795	A	6	6	6473	6478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012795	T	8	8	6524	6531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012795	A	6	6	6554	6559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012795	CCA	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012795	TGAAA	2	10	7237	7246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012795	T	7	7	7264	7270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012795	CAAAAA	2	12	7338	7349	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012795	T	6	6	7453	7458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012795	CTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012795	CGTT	2	8	7489	7496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012795	ATCA	2	8	8785	8792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012795	TTA	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.